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临床微生物学检验数据管理系统及应用


作者:不详   来源:本站   发布时间:2005-11-30 18:07:14  点击数:

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核心提示:  袁应华,万海英同济大学附属同济医院检验科摘要:目的建立临床微生物检验数据管理系统,实现与检验信息管理系统(LIMS)一体化网络管理。方法 根据微生物学检验要求,由微生物检验专业人员与软件开发工程师共同研制数据管理系统,将仪器、手工检验数据互联,并入检验信息管理系统(LIMS)及医院信息管理(HIS)。结果 研制出了功能齐全、

  
  袁应华,万海英
同济大学附属同济医院检验科
摘要:目的 建立临床微生物检验数据管理系统,实现与检验信息管理系统(LIMS)一体化网络管理。方法  根据微生物学检验要求,由微生物检验专业人员与软件开发工程师共同研制数据管理系统,将仪器、手工检验数据互联,并入检验信息管理系统(LIMS)及医院信息管理(HIS)。结果  研制出了功能齐全、操作方便的临床微生物学检验数据管理系统,并能与LIMS系统及HIS一体化网络管理。结论  该系统运行效果衣好,值得推广和应用。
    随着检验医学和电脑网络技术的快速发展,检验医学系统化网络管理日趋普及,检验信息管理系统(LIMS)在检验科工作中的作用尤为重要。但由于临床微生物检验数据类型与临床生化、免疫、血液等差异较大,在实现检验网络一体化方面有一定难度,因此,临床微生物学检验数据管理仅仅停留在单机数据传输、中文报告单打印等简易功能上。我院与上海齐效电脑科技有限公司共同研制开发了LIMS中的微生物检验模块,并实现与医院信息管理系统(HIS)互联,运行效果良好,报道如下:

1 材料与方法

1.1 设备与材料  电脑:DELL OPTIPLEX GX50;全自动细菌鉴定药敏分析仪(VITEK-32),法国生物梅里埃公司产品;全自动血培养仪,美国B-D分公司产品;带条形码的无菌痰杯和试管;手工微生物学检验数据。

1.2 方法 根据微生物学检验操作流程、微生物学检验数据特点,质量控制要求等,由微生物检验专业人员提出设计要求,软件开发工程师编制程序,采用“生命周期法”,即开发、应用、更新、升级相结合的方法,将仪器、手工检验数据互联,并入LIMS系统及HIS系统。

2 结果与讨论

2.1 系统参数设置  建立微生物学检验必需的基本数据库,如菌种名称、检验项目、药敏试验种类等。可根据各实验室的具体需求设定条目,如药敏试验方法,各种细菌测试的药敏种类等。

2.1.1  细菌字典定义:设立菌种名称,检验项目,以及设立每种细菌应做的药敏试验等,如“血培养五天”,“抗酸染色”。为方便检索,设置了项目代码、拼音码等。

2.1.2  细菌试验板定义:K-B法药敏试验,参考NCCLS标准选择测试抗生素,分为肠杆菌科、葡萄球菌、铜绿假单胞菌和不动杆菌组等;全自动细菌鉴定药敏分析仪,则按测试卡分组,如VITEK系统的GNS-121,GPS-107等。

2.1.3  药敏字典定义:设置药敏试验中抗生素名称条目,每一条目对应唯一代码,在输入药敏试验结果时可按试验分组成批输入或单个插入输入。

2.2  标本申请信息录入 采集标本的容器,如痰杯、血培养瓶、无菌试管等,粘贴有微生物检验(咖啡色)专用条形码,护士工作站工作人员通过条码扫描器将条形码扫入电脑与病人基本信息、标本种类、检验项目等(这些信息来自医生的电子医嘱)关联,共同存入LIMS中。标本送达微生物室时,只需在电脑终端通过微生物工作站界面的标本录入窗口,扫描标本标签上的条码或键盘输入该条码号,即可获得上述信息,确认后会自动计账收费,然后开始检验。此外,如果无网上电子医嘱和护士工作站录入,标本达到检验科时,也可采用手工方法录入,以化验单联号码作为标本唯一标志录入,通过住院号获得病人基本信息,再根据化验申请中的信息,输入标本种类、检验项目等等。

2.3  微生物检验操作流程记录  为规范临床微生物检验操作,提高检验质量,上海市临床检验中心规定每份微生物检验标本必须有完整的“操作程序记录”。为此,我们研制出了电子版的检验程序记录”,如表1所示。详细记录从标本采集到最终报告发送的每一操作过程:①实时记录标本采集时间、收到时间以及接种时间。能真正做到客观、真实。②方便记录标本种类、涂片结果、所接种的培养基、培养条件等;常用条目设置为“默认”。③预先设置“固定模块”,快速记录“菌落性状、生化反应”,如“血平板上菌落灰白/黄色,扁平,光滑,边缘整齐,直径3mm左右圆形菌落,β-溶血”;麦康凯平板上为粉红色,黏液样菌落,隆起饱满,直径3mm左右”,“触酶阳/阴性”,“氧化酶阳/阴性”等,可灵活调用及修改。
表1 微生物检验程序记录
同济医院微生物学检验程序记录         标本号0001621
标本种类 痰
菌落性状、生化反应(血清学试验)
收到时间:7.4.8:00
接种时间:7.4.8:05
7.5麦康凯平板上为粉红色菌落,扁平,湿润,直径3mm左右。革兰阴性杆菌,氧化酶阴性。
涂片结果:G-b
接种培养基:血平板、麦康凯、巧克力平板
培养条件:①35℃,5%CO2;18~24h
药敏结果:自动分析仪(记录存盘)
最终报告:鲍曼不动杆菌4+
 
记录人:黄晓霞                          记录日期:2003.7.7
2.4检验报告处理 报告处理窗口如图1(略)所示,按检验项目(或住院/门诊号、条码号、库位号等灵活选用)检索出待发报告的病人信息;细菌名称(或检验项目)输入,采用拼音码,如“fk”表示“肺炎克雷伯菌”,“ks”即“抗酸染色”;菌名弹出的同时,右侧窗口跳出对应的药敏试验条目,输入结果,保存即可。如数据来自仪器,则自动完成数据入库、转换与其它检验报告采用统一模式,在检验报告单的首行印有“微生物”及“报告日期”等字样,报告单贴在病历上时,首行留出,具有标准、规范、无污染、易粘贴和查找等优点;所有报告单在任一指定终端均可打印,如各病区可打印本病区历史或在院的所有报告单。

2.6  流行病学统计 定期为临床提供病原菌分布以及耐药性监测报告是院内感染监测的重要内容之一。本系统的流行病学统计功能,在快速提供准确、全面的监测报告方面优势特别明显。微生物检验数据永久性储存于服务器里,可根据需要提供多参数查询和统计,如统计标本阳性率,菌种分布百分率,抗菌药物敏感百分比等,图2(略)所示。此外,还能统计和打印一些有意义的清单,例如某期间内“抗酸杆菌”或“淋球菌涂片”阳性病人等,快速、方便、准确。

2.7  查询  在微生物检验数据查询方面,功能齐全,较手工方法具有无可比拟的优越性,例如查询某病人历次分离菌及药敏资料,指定住院/门诊号(或姓名等)、日期范围,立刻就能检索出来,方便对比查阅。

2.8  分级报告 微生物检验实验室数据网络管理系统,在实验检验结果的分级报告方面优势更加明显,如标本涂片革兰氏染色结果,“初步报告”上网发送,护士工作站实行弹出消息,临床医师即可据此及时进行诊断和治疗,待正式报告出来之后作相应的调整,为挽救病人赢得宝贵时机。

    由于使用网络条码技术,不仅方便、快捷,最大限度地避免了标本混淆、错留,同时因无需纸质申请单,又可避免污染,减少核对、验收的工作;此外,标本从采集、传送、接种、报告结果等整个环节的时间准确记录在系统中,留存在报告单上,不仅能监督多环节规范操作,而且促使检验人员严把质量关,提高检验质量。
摘自《现代检验医学杂志》2003年第6期


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