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J Phys Chem Lett:揭示HIV等RNA病毒发生碱基翻转事件,有助开发新的病毒治疗方法

日期:2020-07-30 23:02:06 来源: 生物谷 点击:

在一项新的研究中,来自美国新罕布什尔大学的研究人员在RNA病毒中发现了让抑制剂从病毒上脱离下来的新途径。这一发现可能有利于了解这些抑制剂是如何反应的,并有可能帮助开发新一代的药物来治疗高死亡率的病毒,如HIV-1、寨卡病毒、埃博拉病毒和导致COVID-19的新型冠状病毒SARS-CoV-2。相关研究结果近期发表在Journal of Physical Chemistry Letters期刊上,论文标题为“Ligand Recognition in Viral RNA Necessitates Rare Conformational Transitions”。

在这项新的研究中,这些研究人员专门研究了HIV-1病毒的一个RNA片段及其与配体/抑制剂的相互作用,其中这种配体/抑制剂是一种已知干扰病毒复制过程的复杂化合物。利用计算机建模,他们在意外地显示了由RNA碱基组成的结合口袋(binding pocket)的许多部分存在协调运动的几种罕见事件中,发现了抑制剂从病毒RNA上脱离下来的新途径。

这些研究人员重点研究了来自HIV-1 RNA基因组的结构元件,这是因为它们被认为是研究各种RNA病毒中相同过程的良好模型。他们在分子水平上对结合/脱离过程中罕见的结构和构象作用进行了模拟,这些结构和构象作用通常很难在实验室中使用实验方法观察到。

(责任编辑:xsq)

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