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检验科微生物分子检测项目大全

日期:2020-04-26 19:58:39 来源: IVD从业者 作者:锁炎 点击:


我国分子诊断技术的发展紧跟着国际步伐,分子诊断市场快速增长,对于目前国内的企业,PCR试剂依然是分子诊断主要的应用产品,PCR技术在临床诊断中广泛应用。


病原微生物感染是临床最常见的疾病类型,主要由病原微生物(包括朊病毒、病毒、细菌、衣原体、真菌、支原体、立克次氏体、螺旋体、寄生虫)通过不同方式引起人体发生感染并出现临床症状的疾病。


分子诊断技术在感染性疾病中的应用是通过检测病原体的核酸或者蛋白质,从而对其进行鉴定、分型、耐药诊断和治疗过程中的疗效检测和预后判断等。


目前,病毒性肝炎、结核病、性病、流感、艾滋病等一系列感染性疾病可通过分子诊断技术进行诊断和治疗。


那么在检验科能开展的微生物分子检测项目主要有哪些呢?见下表:

检测项目

简称

样本类型(主流)

项目简介

人乳头瘤状病毒分型

HPV

宫颈脱落细胞

高危HPV亚型:与宫颈上皮内瘤样病变密切相关,是导至宫颈癌的主要病因

低危HPV亚型:与尖锐湿疣等良性病变相关

乙型肝炎病毒

HBV

全血、血清、血浆

 乙肝病毒(HBV)是引起急性和慢性乙肝的致病根源,血清HBV DNA 水平是目前临床评价HBV复制的“金标准”。

丙型肝炎病毒

HCV

全血、血清、血浆

丙型肝炎病毒的核糖核酸是表示体内感染HCV的直接指标是丙型肝炎病原学诊断和判断传染性的一项有用的指标

戊型肝炎病毒

HEV

血清(粪便、胆汁)

戊型肝炎传播途径(主要经粪-口途径传播)和临床表现(隐性感染及急性肝炎,不致慢性肝炎等)与甲型肝炎相似。戊型肝炎亦为自限性疾病。HEV对肝细胞亦无直接病变作用(CPE)。核酸检测能够做到早期发现。

肠道病毒通用检测

EV

咽拭子;脑脊液;粪便、疱疹液

包括柯萨奇病毒A类、B类;埃克病毒类;肠道病毒脊髓灰质病毒肠道病毒总型核酸检测是肠道病毒感染筛查的最佳手段。

 

肠道病毒71

EV71

咽拭子;脑脊液;粪便、疱疹液

手足口病是由肠道病毒引起的急性传染病。重症病例多由肠道病毒71型(EV71)感染引起,病情凶险,病死率高。

柯萨奇病毒6/10/16

CA6/10/16

咽拭子;脑脊液;粪便、疱疹液

柯萨奇病毒(Coxsackievirus)是一种肠病毒(enterovirus)分为AB两类,是一类常见的经呼吸道和消化道感染人体的病毒,感染后人会出现发热、打喷嚏、咳嗽等感冒症状。

结核分支杆菌

TB

痰液

结核分支杆菌是细长略带弯曲的杆菌,大小1~4X0.4um能够引起结核病的病原菌。可侵犯全身各器官,但以肺结核为最多见。结核病至今仍为重要的传染病

沙眼衣原体

CT

尿道、生殖道分泌物

ABBaC型的衣原体株能引起沙眼,L1L2L3型能引起性病性淋巴肉芽肿, D-K型则引起非淋菌性尿道炎。沙眼衣原体是引起非淋菌性尿道炎的主要病原体

解脲脲原体

UU

尿道、生殖道分泌物

解脲脲原体是人类泌尿生殖道常见的寄生菌之一,在特定环境下可致病。在人体的定植可有二次上升趋势,即分娩时由母体产道感染新生儿,以后迅速减少;从性生活开始又渐增多。是引起非淋菌性尿道炎的病原体之一。

淋球菌

NG

尿道、生殖道分泌物

引发淋病的病原体是“淋病奈瑟氏菌”,即俗称的淋球菌。

甲型流感病毒

H1H1N1H3H3N2

口咽拭子

急性上呼吸道感染是最常见的一种传染病。常见病因为病毒80%,少数由细菌引起。甲型病毒经常发生抗原变异,传染性大,传播迅速,极易发生大范围流行

肺炎支原体

MP

人口咽拭子、深部鼻咽拭子、痰液

肺炎支原体(M.Pneumonia)是人类支原体肺炎的病原体。支原体肺炎的病理改变以间质性肺炎为主,有时并发支气管肺炎,称为原发性非典型性肺炎。

巨细胞病毒

CMV

血清、血浆、尿液、乳汁

巨细胞病毒(Cytomegalovirus)是一种疱疹病毒组DNA病毒,引起以生殖泌尿系统,中枢神经系统和肝脏疾患为主的各系统感染,从轻微无症状感染直到严重缺陷或死亡。

单纯疱疹病毒

HSV-1/2

尿道拭子、宫颈拭子、疱疹溃疡刮片

纯疱疹是一种由单纯疱疹病毒所致的病毒性皮肤病HSV分为两个血清型HSV-1HSV-2HSV-1的原发感染常局限在口咽部,尤以龈口炎(gingivostomatitis)最为多见,HSV-2的原发感染主要引起生殖器疱疹。

鼻咽癌病毒(EB病毒)

EBV

全血、血清、血浆

该病毒是多种恶性肿瘤(如鼻咽癌)的病因之一,它主要感染人类口咽部的上皮细胞和B淋巴细胞。在中国南方鼻咽癌患病人群中大多都检测到有EB病毒基因组存在。

乙型流感病毒

Victoria系、Yamagata

口咽拭子

乙型流感病毒抗原变异较小,致病性较低,通常只引起流感的局部爆发

呼吸道合胞病毒

RSVRSV-A/B

人咽拭子

呼吸道合胞病毒是一种RNA病毒,属副粘液病毒科。该病经空气飞沫和密切接触传播,是引起小儿病毒性肺炎最常见的病原。

人类免疫缺陷病毒

HIV

血清、血浆

人类免疫缺陷病毒(Human Immunodeficiency Virus;abbr:HIV),即艾滋病(AIDS)病毒,是造成人类免疫系统缺陷的一种病毒,人类免疫缺陷病毒I(感染)在一类致癌物清单中、人类免疫缺陷病毒2(感染)2B类致癌物清单中。

肺炎衣原体

CP

痰液、人咽拭子

2006年我国CAP的大型流调研究显示:与国外研究不同,肺炎支原体是我国CAP的最主要致病菌

B族链球菌

GBS

阴道分泌物、直肠分泌物

1996年美国疾病控制中心(CDC)与其他机构共同制定了《围产期B族链球菌感染筛查及防治指南》,并于2002年和2010年进行了修改,指南建议:建议孕晚期35-37周的女性,采集阴道及直肠拭子进行GBS检测,并对阳性人群采取预防措施。

鲍曼不动杆菌

Ab

痰液

鲍曼不动杆菌(Ab)是医院感染的重要病原菌。近年来的感染在增多,且其耐药性日益严重,已引起临床和微生物学者的严重关注。Ab主要引起呼吸道感染,也可引发败血症、泌尿系感染、继发性脑膜炎等。

肺炎克雷伯菌

KPn

痰液

肺炎克雷伯菌是肠杆菌科克雷伯氏菌属中最为重要的一类菌(俗称肺炎杆菌),其所致疾病占克雷伯氏菌属感染的95%以上。

金黄色葡萄球菌

MRSA

痰液、咽拭子

耐甲氧西林金黄色葡萄球菌是临床上常见的毒性较强的细菌,其感染几乎遍及全球,与艾滋病、乙肝成为世界三大最难解决的感染性疾病,已成为院内和社区感染的重要病原菌之一.

沙门氏菌

salmonella

粪便、肛拭子、血液

沙门氏菌病的病原体。属肠杆菌科,革兰氏阴性肠道杆菌。已发现的近一千种(或菌株)。按其抗原成分,可分为甲、乙、丙、丁、戊等基本菌组。据统计在世界各国的种类细菌性食物中毒中,沙门氏菌引起的食物中毒常列榜首。我国内陆地区也以沙门氏菌为首位。

志贺氏菌

Shigella Castellani

粪便、肛拭子、血液

志贺氏菌属(Shigella Castellani)是一类革兰阴性短小杆菌,是人类细菌性痢疾最为常见的病原菌,主要流行于发展中国家,通称痢疾杆菌,细菌性痢疾是最常见的肠道传染病,夏秋两季患者最多。

风疹病毒

RV

咽拭子、全血

风疹病毒是单正链RNA病毒,属于披膜病毒科(togavirus)是限于人类的病毒,对于孕妇来说,风疹病毒的侵入则会导至胎儿畸形、早产或胎儿亡。

H7N9禽流感病毒

H7N9

人口咽拭子、鼻咽拭子、痰液

H7N9亚型禽流感病毒是甲型流感中的一种

铜绿假单胞菌

P.Aeruginosa

痰液

铜绿假单胞菌肺炎比较容易耐药,而且不易为呼吸防御机制杀灭,所以治疗起来比较困难,病死率比较高,在医院内感染他是占有非常重要的地位的。

白色念珠菌

CA

阴道分泌物、口腔拭子、痰液、血液、脑脊液

念珠菌病主要是白假丝酵母菌引起的急性、亚急性或慢性感染,是最常见的真菌病。常侵犯皮肤、粘膜,也可引起内脏或全身感染。临床症状错综复杂,急缓不一。儿童多为急性继发性感染。

腺病毒

AdV

人咽拭子

腺病毒对呼吸道、胃肠道、尿道和膀胱、眼、肝脏等均可感染,人腺病毒约1/3的已知血清型通常与人类疾病相关

寨卡病毒

ZikaV

血清、唾液、尿液

寨卡病毒通过蚊虫叮咬传播。被感染后的常见征状包括发烧、疹子、关节疼痛、肌肉疼痛、头痛和结膜炎(红眼)。其病情通常较温和,征状可持续数日至一周。

变形杆菌

proteus species

痰液

可引起多种感染食物中毒,上腹部刀绞样痛和急性腹泻,伴有恶心、呕吐、头痛、发热。病程较短,一般1~3天可恢复。

产气肠杆菌

Enterobacteraerogenes

痰液

1)有发热及咳嗽等呼吸道症状。

2)肺部体检有湿音。

3)肺部X线检查有浸润性炎症病灶或肺纹理增粗。

4)痰培养产气肠杆菌占正常菌群的60%以上。

大肠埃希菌

E.coli

痰液

大肠埃希菌的致病物质之一是血浆凝固酶。根据致病性的不同,致泻性大肠埃希菌被分为产肠毒素性大肠埃希菌、肠道侵袭性大肠埃希菌、肠道致病性大肠埃希菌、肠集聚性黏附性大肠埃希菌和肠出血性大肠埃希菌5种。

发热伴血小板减少综合征布尼亚病毒

SFTSV

血清

发热伴血小板减少综合征布尼亚病毒(SFTSVsevere fever with thrombocytopenia syndrome bunyavirus),简称"新布尼亚病毒",一种新的布尼亚(Bunya)科病毒,发热伴血小板减少综合征(俗称蜱咬病,一种以严重发热伴血小板减少为主要特征的新型传染性疾病)的致病原

肺炎链球菌


痰液

5%~10%正常人上呼吸道中携带此菌。有毒株是引起人类疾病的重要病原菌。

流感嗜血杆菌

 

Haemophilus influenzae

痰液

部份流感嗜血杆菌都是机会性感染细菌,即它们会在寄主体内生存而不引起任何疾病,但当某一些因素(如病毒感染或免疫力下降)出现后则会引发病症。由流感嗜血杆菌自然产生的疾病只会在人类出现。在婴儿及孩童中,乙型流感嗜血杆菌会引致菌血病症及急性细菌性脑膜炎

麻疹病毒

MV

人咽拭子、全血

麻疹病毒是引起麻疹的病原体,呈球状,内核为单链RNA,螺旋对称,有包膜,其上含血凝素。麻疹是小儿常见的传染病,传染性强,发病率高,并易与支气管性肺炎或脑膜炎并发,患并发症者病死率高。

人副流感病毒

HPIV

人咽拭子

人类副流感病毒(HPIVs)常常引起儿童下呼吸道感染的一种病毒,其致病性仅次于呼吸道合胞病毒 (RSV)。与RSV一样,人类副流感病毒可以造成反复发作的上呼吸道感染(如感冒和喉咙痛)。它也能造成严重的反复感染的下呼吸道疾病(如肺炎,支气管炎和细支气管炎),特别是在老年人中和有免疫缺陷人群中

人型支原体

MH

尿道分泌物、阴道分泌物

人型支原体(M.hominisMH),人型支原体是支原体的一种,它存在于泌尿系和生殖器中,可以引起泌尿系的感染和生殖器的炎症

生殖支原体

MG

尿道分泌物、阴道分泌物

生殖支原体有最小基因序列,是在体外能自我复制的最小微生物。已证实除引起尿道炎外,且伴有抗体形成,并与前列腺炎、盆腔炎性疾病有关。

嗜麦芽窄食单胞菌

Stenotrophomonas maltophilia

痰液

嗜麦芽寡养(窄食单胞菌(Stenotrophomonas maltophilia)为条件致病菌,随着临床抗生素和免疫抑制的广泛和大剂量应用,其分离率在非发酵菌属中呈上升趋势,因该菌对多种抗生素耐药,因而给临床治疗带来很大困难。

细小脲原体

UP

生殖道,尿道分泌物

般为表面感染,大多不侵入血液,其所致疾病最常见为非淋菌性尿道炎,若上行感染可使女性得阴道炎,宫颈炎,并可感染胎儿导至流产、早产及低体重胎儿

弓形虫

TOX

全血

孕妇在怀孕期间发生原发性感染(即第一次或初次的感染),可以通过胎盘传染给胎儿,先天性感染是最重要的一种感染途径

真菌

Fungus

阴道分泌物、痰液

真菌感染性疾病根据真菌侵犯人体的部位分为4:浅表真菌病、皮肤真菌病、皮下组织真菌病和系统性真菌病;前二者合称为浅部真菌病,后二者又称为深部真菌病。

热带假丝酵母菌


痰液、创口拭子

10%的健康妇女和30%的孕妇可无任何临床症状而阴道内带有念珠菌。当机体抵抗力降低或阴道局部环境发生改变时,热带念珠菌就大量繁殖,产生病变。所以,热带念珠菌是一种条件致病菌。

光滑假丝酵母菌


痰液、创口拭子

假丝酵母菌大量繁殖,并转变为菌丝相鵻,引发阴道炎症状。

中东呼吸综合征冠状病毒

MERS

鼻咽拭子、痰样本

世界卫生组织2013528日宣布,世卫组织已接受国际病毒分类委员会冠状病毒研究小组的建议,将新型冠状病毒名称定为"中东呼吸系统综合征冠状病毒"

登革病毒

DENV

血清

登革病毒属于黄病毒科黄病毒属中的一个血清型亚群,主要通过埃及伊蚊和白纹伊蚊等媒介昆虫传播,引起登革热以及发病率和死亡率很高的登革出血热和登革休克综合征。

A组链球菌

GAS

人咽拭子

类约90%的链球菌感染是由A族链球菌引起的。常见的传播方式为通过呼吸道传播。在炎热的季节多为皮肤感染。

BK病毒

BKV

血清、血浆、尿液

BK病毒(BK virus, BKV)是1971GARDNER在一位肾移植后出现肾功能衰竭伴输尿管狭窄患者的尿液样本中首次分离得到的一种新型的病毒并以该患者姓名首字母缩写命名。BKV在普通人群中的感染率高达80%。近年来随着器官移植术的广泛开展及强效免疫抑制剂的使用, BKV感染已成为肾脏移植后功能丧失及骨髓移植后急性肾功能衰竭的重要原因

JC病毒

JCV

血清、血浆、尿液

JCV是多瘤病毒科成员,最初在进行性多病灶脑白质病患者的脑中发现,这是一种罕见的和免疫损伤结合的脱神经髓鞘的疾病。

20171027日,世界卫生组织国际癌症研究机构公布的致癌物清单初步整理参考,JC多瘤病毒(JCV)2B类致癌物清单中。

耐万古霉素肠球菌

VRE

尿液

抗万古霉素肠球菌(Vancomycin-Resistant Enterococcus,简称VRE),又名万古霉素抗药性肠球菌,是肠球菌属下的一种细菌,有着对万古霉素这种抗生素的抗药性。

诺如病毒

NoV

粪便

诺如病毒感染性腹泻在全世界范围内均有流行,全年均可发生感染,感染对象主要是成人和学龄儿童,寒冷季节呈现高发。

人鼻病毒

RhV

痰液、咽拭子

人鼻病毒是小RNA病毒科、鼻病毒属的一种,是人患普通感冒的主要病原。

人博卡病毒

HBoV

痰液、咽拭子

博卡病毒(Bocavirus)是细小病毒科细小病毒亚科的一个属,与人类急性呼吸道感染密切相关,病征与普通感冒相似。

嗜肺军团菌

LP

痰液

肺炎的病原,嗜肺军团菌是一种细胞兼性寄生的细菌,可入侵变形虫,或是人类的巨噬细胞内。

幽门螺旋杆菌

HP

胃粘膜组织

幽门螺杆菌或幽门螺旋菌,英文名Helicobacterpylori,简称Hp。是革兰氏阴性、微需氧的细菌,生存于胃部及十二指肠的各区域内。它会引起胃黏膜轻微的慢性发炎,甚或导至胃及十二指肠溃疡与胃癌

新型冠状病毒

2019-nCoV


咽拭子、 鼻咽拭子、痰液等

2019新型冠状病毒,2020年1月12日被世界卫生组织命名为2019-nCoV,2020年2月11日被国际病毒分类委员会命名为SARS-CoV-2。



(责任编辑:xsq)

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